A Área de Proteção Marinha ao redor de Nusa Lembongan, estabelecida em 2010, protege 200 quilômetros quadrados de ecossistemas de recifes e designa 16 locais de mergulho nomeados, acessíveis dentro de uma viagem de barco de 20 minutos do porto de Jungut Batu. A visibilidade da água é em média de 15 a 30 metros durante todo o ano, com termoclinas caindo para 18°C durante a temporada de ressurgência de agosto a outubro, quando o mola mola—peixe-lua oceânico que excede 2.000 quilogramas—ascende de canais mais profundos para estações de limpeza perto de Crystal Bay e Manta Point. Operadores afiliados à PADI na ilha oferecem a progressão completa de certificações recreativas: sessões introdutórias de Discover Scuba Diving para iniciantes, cursos de Open Water Diver com duração de três a quatro dias com habilidades em águas confinadas e quatro mergulhos de treinamento em águas abertas, e módulos de Advanced Open Water com foco em mergulho à deriva e especialidades de mergulho profundo adequadas à topografia da ilha varrida por correntes. Os locais do norte—Blue Corner, Jackfish Point, Mangrove—apresentam jardins de corais suavemente inclinados e espécies macro, incluindo cavalos-marinhos pigmeus e enguias-fita, enquanto a exposição sul em Ceningan Wall apresenta paredes verticais de até 40 metros e avistamentos regulares de tubarões-de-pontas-brancas e cardumes de carapaus. A zona protegida proíbe métodos de pesca destrutivos e ancoragem em corais vivos, resultando em biomassa de peixes notavelmente maior em comparação com zonas não regulamentadas 15 quilômetros a leste. Dados de levantamento de 2024 documentaram populações de raias-jamanta estáveis em aproximadamente 120 indivíduos frequentando o canal entre Lembongan e Penida, com estações de limpeza ativas nas marés de enchente, quando a densidade de plâncton atinge o pico. A infraestrutura de superfície expandiu-se em 2022, quando três centros de mergulho adicionaram sistemas de membrana de nitrox e compressor atualizado para acomodar 40 mergulhadores por dia sem degradação da qualidade. Os cronogramas dos cursos seguem a estrutura modular da PADI: teoria via e-learning concluída antes da chegada, sessões em águas confinadas na baía calma do nordeste antes das 10:00 e mergulhos de verificação em locais intermediários onde a profundidade máxima permanece dentro dos limites da certificação. Os instrutores mantêm uma proporção de 4:1 de alunos para programas Open Water e 2:1 para participantes do Discover Scuba. A taxa do parque marinho—100.000 IDR por pessoa por dia—financia patrulhas de guardas florestais e manutenção de boias de amarração em todos os 16 locais, coletada no check-in da loja antes da emissão do equipamento.